Af protein struktur principper: November 2011




Forskning i biologi ved Birkbeck, og andre relaterede services til den nærliggende University College London, kombineres i Institut for Structural Molecular Biology. Instituttet har en regelmæssig seminar program - hver onsdag under frokost termtime - som opfordrer fremragende forskere, mange med links til universiteter, til at præsentere deres forskning. For et par uger siden, ordføreren seminaret var en elektron microscopist, Sarah Butcher, der er baseret på universitetet i Helsinki, Finland. Hans gruppe har studeret strukturen af ​​en virus, der forårsager en velkendt sygdom: mæslinger.

Mæslinger har været kendt i årtusinder. Sygdommen (selv om det naturligvis ikke dens årsag) er blevet beskrevet i det gamle Egypten. Det er en af ​​de mest kendte smitsomme virus, men de mennesker, de møder mæslinger (hvis overhovedet) som en lidelse ubehagelig barndom er ofte overrasket over at erfare, at det er en morder. Omkring 164.000 mennesker mistede livet som følge af mæslinger i 2008, de fleste af den vedvarende immunosuppression, snarere end akut infektion. De fleste dødsfald sker i Afrika og Sydasien; en mindre epidemier har for nylig dukket op i Storbritannien, hvor MFR-vaccination mistede popularitet over MFR autisme skræmme.

Den mæslingevirus er et paramyxovirus; en indkapslede vira med en enkelt streng af RNA som sit genom, og tæt forbundet med virus, der forårsager fåresyge, respiratorisk syncytialvirus infektion (RSV) og para-influenza hos spædbørn og børn. Det har to overfladeproteiner og IIS menes at direkte forbinde membranerne fra inficerede celler med en af ​​disse.

Indtil for nylig strukturelle studier af mæslingevirus er ret begrænset. Mange grupper har undersøgt ved anvendelse af en negativ farvning elektronmikroskopi teknik kaldet, men det kan kun se overfladen af ​​virus '. Strukturer af et intakt protein med mæslingevirus og de andre tre domæner blev deponeret i Protein Data Bank; hæmagglutinin (f.eks FBF 2RKC kode); to separate domæner af phosphoprotein (1OKS og 2K9D) og en struktur af fragmenter af to proteiner blot kaldet P og N bundet sammen (1T60).

Sarah Butcher og hans team anvendt en teknik kaldet cryo-elektronmikroskopi, som tillader det indvendige af virusset til at vise, at studere mæslingevirus. Deres resultater førte dem til at fokusere på proteinet matrix, som menes at være vigtigt for samlesteds af virusset (cyan farvet protein i billederne nedenfor). Alle tidligere modeller havde til at placere matrixen protein, der dækker den indre del af den virale membran. Hvad gruppen Butcher oplevede, var dog helt anderledes. De kunne se dele af nukleokapsidproteinet omkring - det virale RNA og dets beskyttende protein associeret - og yderligere analyse identificeres dette som proteinmatricen. Den strengt til dele af nucleocapsid legering matrix for at opnå stang-lignende strukturer, og disse bøjning i anti-parallelle enheder, der er lidt remniscent antiparallelle beta-sheets i proteiner. Dette mønster antyder, at virusreplikation proces bliver mere kompliceret og gjort flere potentielle lægemiddelmål end hidtil antaget.
to modeller for tilrettelæggelsen af ​​proteiner og RNA af mæslingevirus. Top: den gamle model, med matrixen protein (cyan), der omgiver virusset pels. Nederst: slagteren gruppen model, med matrix-protein omkringliggende dele af nucleocapsid. Credit Figur:. Proc Nat. Acad. Sci. USA (2011)


Strukturer af proteiner fra andre virus, især HIV og influenza, vil blive dækket ganske udførligt senere i PPS. os ikke studere den anvendte teknik i denne undersøgelse mikroskopi, cryo-elektron, PPS men en del af en af ​​de muligheder for andet år kurset KKS, Teknikker Structural Molekylær Biolog



Efterlad en kommentar